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Dentro de las teorías más aceptadas en la actualidad sobre el origen de la AD, se encuentra la teoría inflamatoria (según la cual la enfermedad es resultado del daño del parénquima noble por una reacción glial inflamatoria) y la neurotóxica (según ella, la enfermedad es resultado del daño por agentes neurotóxicos). Se acepta que la AD sería el resultado de la suma de ambas.
1-El metabolismo de la proteina precursora del b-amiloide (APP) es central en la patogénesis de la enfermedad de Alzheimer. 2-Los fragmentos solubles son resultado de la accción de la b-secretasa sobre la APP y pueden tener 40 ó 42 aminoácidos (Ab-40 y Ab-42). 3-En condiciones patológicas, los fragmentos Ab-42 tienden a agregarse en conformación de lámina beta (Ab-insoluble). 4- Esto también contribuye a la formación de placas seniles, constituidas por ovillos neurofibrilares rodeados de un retículo de prolongaciones degeneradas, astrocitos y células de la microglia y muertas. 5- Por otro lado, el Ab-insoluble activa la cascada del complemento. 6- Este a su vez, estimula a las células de la microglia. 7- La microglia contribuye a la inflamación. 8- En cambio el Ab-40 puede ser neurotóxico debido a su capacidad de activar los canales de Ca2+ unidos a los receptores de los aminoácidos exitatorios. 9- Las neuronas afectadas sufren la desestabilización del citoesqueleto. 10- Esto se debe a la formación de filamentos helicoidales de la proteína Tau hiperfosforilada (proteína asociada a los microfilamentos). 11- Estas estructuras se agregan formando ovillos neurofibrilares. Estos ovillos determinan la formación de neuritas distróficas centro de la placa amiloide. Como consecuencia se pierden neuronas corticales que comprometen los circuitos locales y distantes. 12- Los ovillos neurofibrilares también impiden la incorporación de factores neurotróficos (NGF) que desencadena la degeneración retrógrada de las neuronas colinérgicas, exacerbando la AD. 13- La colina es fundamental para el recambio de los lípidos de membrana y la síntesis de acetilcolina. El menoscabo en su incorporación a las neuronas genera el autocanibalismo. 14- Por último, la estimulación de los receptores de membrana de la acetilcolina (M1 y M3) genera la fosforilación del APP y promueve una vía no amiloidogénica, resultado de la acción de la alfa-secretasa sobre el sustrato fosforilado. Ello frena un ciclo de retroalimentación positiva, que conduce a la AD. Por consiguiente, la falta de acetilcolina deja sin efecto este freno.

La TEORIA INFLAMATORIA indica que el núcleo es un centro flogógeno que atrae microglia y que se autoperpetúa por más depósito, liberación de mediadores y radicales libres del oxigeno. Estos a su vez dañan las neuronas vecinas y estas responden generando neuritas anómalas. Finalmente, la muerte neuronal agranda la placa hacia afuera y cierra el círculo atrayendo más microglia y astrocitos reactivos. La TEORIA NEUROTOXICA indica que además del bA42, la forma soluble bA40 puede actuar favoreciendo la entrada de calcio en forma desmedida y ello desencadena la excitotoxicidad neuronal característica. Probablemente este mecanismo actúe sinérgicamente con el anterior para producir necrosis. La TEORIA APOPTOTICA indica que el resto de bAPP que queda en la membrana reduce constitutivamente los niveles de AMPc y ello desencadena la apoptosis (mecanismos de daño del citoesqueleto). Los ovillos neurofibrilares se forman por una variante de la proteína Tau del citoesqueleto. Esta variante altamente fosforilada altera por precipitación intracelular a nivel axónico o dendrítico toda la estructura y función del terminal nervioso. En suma, las neuronas tienden a retrotraerse y eso conmina la apoptosis.